Claude akrep toksinlerine bağlanan proteinler tasarladı, henüz bir panzehir yok

Anthropic, Claude’un araçlarla çalışabilen yapısını bu kez protein tasarımında sınadı. Şirketin 20 Ekim tarihli araştırması, modelin 64 saatte 318.484 aday tasarım oluşturduğunu açıklıyor. Laboratuvar değerlendirmeleri sonunda akrep toksinlerine bağlanan 17 tasarım belirlendi. Ancak çalışma, insanlarda kullanılabilecek bir panzehir geliştirdiğini veya zehrin etkisini ortadan kaldırdığını henüz göstermiyor.

Çalışmada herkesin erişebildiği standart sohbet oturumundan farklı, araştırma amaçlı ve yayımlanmamış bir Claude sürümü kullanıldı. Model, Claude Science ortamında protein tasarımı ve değerlendirmeye yönelik araçlarla çalıştı. Bu ayrım önemli, çünkü açıklanan sonuç doğrudan normal bir sohbet kutusuna aynı isteği yazarak tekrarlanabilecek hazır bir ürün özelliği sunmuyor.

Araştırmacılar, Meksika, Brezilya, Kuzey Afrika ve Orta Doğu’daki akrep türleriyle bağlantılı beş nörotoksini hedefledi. Modelin çok sayıda tasarım üretmesinin ardından ekip, gerçek laboratuvar değerlendirmesi için daha küçük bir grup seçti. Bilgisayarda iyi görünen adayların tamamı, deneyde aynı sonucu vermedi.

Bunun yanında Anthropic’in açık veri paketi, değerlendirilen 211 tasarımın sonuçlarını ayrı ayrı yayımlıyor. Adaptyv Bio ve Twist Bioscience, yüzey plazmon rezonansı yöntemiyle bağlanmayı ölçtü. Veriler yalnızca başarı gösteren örnekleri değil, bağlanma göstermeyen veya sonucu belirsiz kalan tasarımları da içeriyor. Böylece şirketin özet açıklamasını ayrıntılı deney kayıtlarıyla karşılaştırmak mümkün oluyor.

Veri paketinin tanımına göre 17 bağlayıcının yedisi Cn2, dördü AaH II, dördü AaH I ve ikisi LqhIII toksinine yönelik. Ts1 için aynı ölçütleri karşılayan bir bağlayıcı bulunmadı. Ayrıca LqhIII yalnızca Adaptyv Bio’da ölçüldü. Bu nedenle bütün başarılı tasarımların iki laboratuvarda aynı deneyle doğrulandığını söylemek doğru olmaz.

Toksine bağlanmak, zehri etkisizleştirdiğini göstermek anlamına gelmiyor

Öte yandan bir proteinin belirli bir toksine tutunması, o toksinin sinir hücreleri üzerindeki etkisini durdurduğunu kendiliğinden kanıtlamıyor. Veri açıklaması, Cn2-B1 için beklenen nötralizasyonun hücrelerde elektriksel kayıt yöntemiyle henüz sınanmadığını özellikle belirtiyor. Bu sonuç, tedavi başarısından önce gelen bir araştırma adımını tarif ediyor.

Çalışma ayrıca laboratuvarda hazırlanmış belirli toksinlerle yürütüldü. Gerçek akrep zehrinin bütün bileşenleri, canlı organizmadaki davranış, güvenlik ve kalıcılık aynı deneyin konusu değildi. Dolayısıyla açıklanan bağlanma başarısı, hastanede kullanılabilecek bir ürünün güvenliğini veya etkinliğini göstermiyor.

Araştırmacılar tasarımları, ölçüm kayıtlarını ve tahmini yapıları CC BY 4.0 lisansıyla erişime açtı. Bu paylaşım başka ekiplerin sonuçları incelemesine ve yeni deneyler planlamasına imkân veriyor. Sonraki aşamada belirleyici olacak nokta, adayların yalnızca toksine bağlanması değil, onun biyolojik etkisini gerçekten engelleyip engellemediğinin ölçülmesi.